El Colegio fue fundado en el año 1983 por el Sr. Carlos Grazzioso Mirabelli con el nombre Colegio Bilingüe San Juan en la 37 avenida de la zona 7 de Ciudad Guatemala. En el año 1998 fue adquirido por una nueva administración y trasladado a otro inmueble.

 

En el año 2003 nos trasladamos a Colonia Bosques de San Nicolás. Debido al crecimiento del Colegio, en el año 2016 se aperturamos las nuevas instalaciones sobre el Boulevard El Naranjo, lugar donde nos encontramos actualmente.

​

El Colegio ha llevado siempre el nombre San Juan en honor a San Juan Bosco, a quien consideramos patrono del establecimiento, tratando de seguir su ejemplo formando "BUENOS CRISTIANOS Y HONRADOS CIUDADANOS". En la actualidad se busca fortalecer los valores y principios que ha caracterizado al Colegio Bilingüe San Juan desde su fundación.